抗体可开发性评估:专家审核的从序列到报告的 in silico 流程。我们提供编号与 CDR 注释、胚系检索、可开发性与免疫原性预测、结构建模与界面分析、结构驱动人源化及亲和力成熟。
Therasik 基于临床与科学文献数据结合机器学习,采用干湿结合的计算与实验流程,助力临床转化。所有交付物经专家审核,通常在 3–5 个工作日内完成。了解更多 →
抗体可开发性评估
专家审核的计算抗体分析、评估与基因工程人源化,服务于药物发现与开发。
免责声明:Therasik 的 in silico 分析仅供参考,不能替代最终湿实验验证。需进行实验确认。
平台
抗体可开发性评估平台提供计算分析、评估、基因工程人源化及结构驱动亲和力成熟服务,服务于抗体药物发现与开发。我们以序列为主——在线提交 VH/VL 或 VHH 序列即可;需要时我们可自行建模。专家将交付涵盖编号、胚系检索、可开发性、免疫原性、结构评估、界面分析、人源化设计与亲和力成熟的结构化报告。
所有服务均经专家审核,线下交付——通常在项目确认后 3–5 个工作日内完成。我们的流程基于 1,142 条临床抗体序列,采用透明指标。人源化采用结构驱动回突变,优先使用临床抗体胚系。所有人源化交付物均包含结构评估。
序列
序列分析
- 编号与 CDR 注释 — IMGT/Kabat 方案,FR/CDR 界定
- 胚系检索 — 最近胚系及与 1,142 条临床抗体序列的 identity (%)
- VH/VL 配对 — 临床抗体中的共现频率
输入:VH/VL 序列
可开发性
可开发性与 CMC
- 理化 — pI、GRAVY、不稳定指数、净电荷
- SAP — 9-mer 疏水与 7-mer 电荷聚集倾向
- CDR 化学风险 — 脱酰胺(NG/NS)、氧化(M/W)、糖基化(NxS/T)、游离 Cys
- TAP — Total CDR length、PSH、PPC、PNC、SFvCSP(Therasik 自研,含参考阈值)。需 PDB 与 CDR 序列。
- CMC 设计 — pI 调整、FR-only 突变建议
输入:VH/VL 序列。TAP 需 PDB 与 CDR 序列。
免疫原性
免疫原性评估
- MHC-II 27 等位基因 — IEDB 预测、FR 表面风险评估
- 风险聚类 — 高风险位点凝聚聚类
- 表面免疫原性 — Parker 亲水性;SASA 分析(提供 PDB 时可选)
- 胚系耐受 — IGHV/IGKV/IGLV 频率加权过滤
输入:VH/VL 序列(PDB 可选)
结构
结构与界面
- 全抗体 (Fab) 评估 — 13 参数:VH-VL 夹角、界面接触、Vernier SASA、CDR 构型、pLDDT
- VHH 评估 — 单域结构指标、CDR 构型、pLDDT
- 抗原-抗体复合物评估 — BSA、paratope/epitope 残基、H 键、盐桥、疏水接触
- 多抗体比较 — 表位重叠、竞争分析、BSA/SC 对比(按需)
输入:PDB(Fab、VHH 或抗原-抗体复合物)。界面分析需抗原链 ID。
亲和力成熟
结构驱动亲和力成熟
基于现有复合物结构。无需从头结构生成。所有交付物均含结构评估。
- 抗原-抗体亲和力成熟 — 基于 Ab-Ag 复合物骨架的 CDR 重设计,提升结合
- 配体-受体亲和力成熟 — 配体-受体复合物上的 paratope 优化
- VHH 亲和力成熟 — VHH-抗原复合物上的 CDR 优化
输入:现有复合物 PDB。设计区域(如 CDR-H3)按项目指定。
人源化
基因工程人源化服务
所有人源化交付物均含结构评估。VH/VL 流程采用结构驱动回突变,优先使用 1,142 条临床抗体序列胚系。
| 服务 | 输入 | 技术 |
|---|---|---|
| VH/VL 人源化 | 鼠源 VH 与 VL | AbEngineCore V4.4 流程。结构驱动回突变,优先 842 条临床抗体胚系。CDR 移植 + 表面重塑备选。含结构评估。 |
| VHH 人源化 | 驼源或羊驼 VHH | 表面重塑与框架移植结合。保留 CDR 与结构特征。含结构评估。 |
| VH 转 VHH | 常规 VH(来自 mAb) | CDR 移植至人源 VHH 骨架,结构引导优化。专家设计服务。含结构评估。 |
完整报告
完整评估报告
涵盖序列、胚系、可开发性、免疫原性、结构与界面分析的综合报告。Markdown 或 PDF 交付,可选 JSON。通常项目确认后 3–5 个工作日完成。
输入:VH/VL 序列(PDB 可选)
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